Struktur kepengurusan Pondok Pesantren Riyadlus Sholihin disusun untuk mendukung kelancaran kegiatan pendidikan dan operasional pesantren secara efektif dan terorganisir.
Adapun susunan kepengurusan secara umum meliputi:
- Pengasuh / Pimpinan Pondok
- Wakil Pengasuh
- Ketua Pengurus
- Sekretaris
- Bendahara
- Bidang Pendidikan
- Bidang Kesantrian
- Bidang Sarana dan Prasarana
- Bidang Humas
Struktur ini bersifat dinamis dan dapat disesuaikan dengan kebutuhan pesantren dalam menjalankan program-programnya.